Κόκκοι : Neisseria, Moraxella, Veillonella
Βακτηρίδια : Όλα τα μέλη της οικογένειας Enterobacterales και Pseudomonas, Burkholderia, Stenotrophomonas, Acinetobacter, Vibrio, Campylobacter, Helicobacter, Haemophilus, Pasteurella, Brucella, Bordetella, Bartonella, Legionella, Francisella, Treponema, Borrelia, Leptospira, Rickettsia, Coxiella, Ehrlichia, Chlamydia και Chlamydophila
και τα αναερόβια : Bacteroides, Fusobacterium Prevotella και Porphyromonas
Κόκκοι : Staphylococcus, Streptococcus και Enterococcus.
Βακτηρίδια αερόβια (ορισμένα υποχρεωτικώς αερόβια και άλλα αερόβια και δυνητικώς αναερόβια) : Bacillus, Mycobacterium, Corynebacterium, Listeria, Nocardia, Gardnerella, Mycoplasma.
Βακτηρίδια αναερόβια : Actinomyces, Clostridium, Lactobacillus, Propionibacterium
Η πλειοψηφία τους είναι Gram-αρνητικά και εξ αυτών τα περισσότερα ανήκουν στα γ-πρωτεοβακτήρια.
Τα Gram-θετικά κατατάσσονται ανάλογα με την αναλογία G-C στο γονιδίωμά τους : χαμηλή – Firmicutes και υψηλή – Actinobacteria. Στα Gram-θετικά κατατάσσονται και τα μυκοπλάσματα παρ’ όλο που δεν έχουν κυτταρικό τοίχωμα.
